Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl11Q9CQF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl11Q9CQF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms