Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms