Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms