Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921530L21RikQ9CQ47 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms