Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl17Q9CPR4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl17Q9CPR4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms