Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms