Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms