Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NsmfQ99NF2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms