Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl3Q99N95 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms