Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erc1Q99MI1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erc1Q99MI1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erc1Q99MI1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms