Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99LU8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99LU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99LU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99LU8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q99LU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Q99LU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99LU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99LU8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99LU8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99LU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99LU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms