Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms