Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms