Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q99KU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q99KU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q99KU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q99KU6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q99KU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q99KU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms