Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DhddsQ99KU1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DhddsQ99KU1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms