Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lactb2Q99KR3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms