Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clint1Q99KN9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms