Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps4Q99KG7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms