Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrabdQ99JY4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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