Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg5Q99J83 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms