Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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