Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfdQ925I7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms