Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csmd1Q923L3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms