Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spdl1Q923A2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spdl1Q923A2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Spdl1Q923A2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms