Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn1Q922Y1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn1Q922Y1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms