Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms