Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms