Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3bQ91ZU9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3bQ91ZU9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3bQ91ZU9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3bQ91ZU9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms