Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4bQ91ZR1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms