Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpe65Q91ZQ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms