Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc49Q91YK0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms