Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm2Q91YD4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm2Q91YD4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm2Q91YD4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm2Q91YD4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm2Q91YD4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms