Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms