Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfxn3Q91V61 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfxn3Q91V61 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms