Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb1Q8VHS2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.3 ms