Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms