Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms