Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms