Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms