Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms