Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms