Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pof1bQ8K4L4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pof1bQ8K4L4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms