Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms