Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OptnQ8K3K8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms