Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ssh3Q8K330 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms