Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms