Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms