Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc12Q8K2L8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms