Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Depp1Q8K2F3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms