Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms